このページではNCBIが提供するリソースの全貌を紹介します。最終更新: 2022.10.25

文献検索

  • Pubmed: 論文検索。3300万文献を収録。
  • PubMed Central: 無料で全文を読める730万文献を収録。
  • Bookshelf: 無料で読める本や報告書89万点を収録。

ゲノム

  • Nucleotide: DNAやRNA配列、4億7千万エントリー。
  • Biosample: NGS解析に使われたサンプル。1900万エントリー。
  • SRA: 次世代シークエンサーで調べられたDNAやRNA配列1600万エントリー。
  • Taxonomy: 生物250万種の分類・命名法カタログ。
  • Assembly:  ゲノムアセンブリ110万エントリー
  • Bioproject: NCBIにデータを拠出している53万プロジェクト
  • Genome: 6万4千生物種のゲノム
  • BioCollections: 博物館、薬草園、自然公園など8000施設

NCBIは現在、SRA全体をAWSとGoogle Cloud Platform (GCP) の2つの商用クラウド基盤上で維持している (解説)。SRAランのメタデータ、BioProjectデータ、BioSampleデータは、GCP BigQueryとAWS Athenaを通じて利用可能(詳細)。