計算創薬科学の研究室 (大学院) をお探しの方へ
国立大学法人東京医科歯科大学・M&Dデータ科学センター・AIシステム医科学分野のホームページへようこそ。本学は2024年に東工大と統合し、理系の東大、日本のMITとして世界に伍する研究大学の一翼を担いその研究成果を通じて社会に還元しようとしています。
その東京医科歯科大学に2022年に発足したのがAIシステム医科学分野で、医療や生命科学の専門的な知識のみならず数理情報科学への高い専門性を武器に、AI創薬等について数々の名門誌にこれまで論文を発表してきており、また多くのメディアにも取り上げていただきました。
また、近年は核酸・ペプチド創薬治療研究センター (TIDEセンター) の構成メンバーとして、中分子創薬、中分子のin silicoデザインにも取り組んでいます。
大学院生らも毎年のようにCBI学会に出席し、最新の知見の取得に励んでいます (例えばこちら)。
研究と同時に大きな力を注いで来たのが次世代の卓越研究者の養成で、例えば本学に限らず全国の意欲的な学生がオンラインでAIやデータサイエンスを学ぶBiomedical Data Science Clubの主催や、オンラインによる研究指導で他大学の学部生に筆頭著者として論文を国際誌に投稿するまで指導したことも複数あります。
ただオンラインで教育できることは一定の限りもあり、よりたくさんのことを吸収してin silico創薬等の次世代の研究者・指導者になりたいという熱意ある方を対象にした大学院生を募集しています。私たちの研究室は東京医科歯科大学にありますが、医学部・歯学部以外の方も大歓迎です。
正直なところ、大学院生がここまでたくさんのことを学べるラボは他にないと自負しています。一例をあげれば、
- 机・椅子・ロッカー
- デスクトップコンピューターおよび高速Wifi環境
- ラボ共通図書 (関連書300冊)
- スーパーコンピューターSHIROKANE最上級モード(D9モード) およびデータストレージサーバーSHIRAUMEアクセス権 (家からでも利用可)
- MATLAB, Mathematica, Illustrator, Gaussianといった研究を行う上で不可欠の有償ソフトウェア
- 配属前に学習するオンライン予習教材 (200時間分の演習教材)
- 実験や情報解析に関わる膨大なオンライン教材・リソース (1万ページ以上、在宅で勉強可能)
- (希望者のみ) 一通りの分子細胞生物学実験環境および共用の専門実験機器
- (希望者のみ) 3Dプリンターを含む先端技術へのアクセスと企業との連携の場
- 生命科学や医学を未履修者を対象にした集中勉強会 (2ヶ月)
- ライフサイエンス系学術論文に頻用される図表の読み方を集中的に学ぶ勉強会 (1ヶ月)
- 米国マサチューセッツ工科大 (MIT) ・人工知能研究所 (CSAIL) で使われているのと同じ教材を使ったML特論 (2年コース)
- システム生物学, 数理生物学, 合成生物学, 量子情報科学等の多様な周辺領域を学ぶCS (convergence science) 特論 (2年コース)
- アットホームなラボ環境、ラボメンバーおよびM&Dデータ科学センター
- JR御茶ノ水駅から徒歩3分、東京のど真ん中にあるので各種学びの機会にも参加しやすい環境
- 国内でもトップクラスの優秀な同期・先輩後輩と切磋琢磨する場
- バイオメディカルデータサイエンスとその関連領域における人脈ネットワーク (清水研は30年続くので今後同門の方がたくさん輩出されるでしょう)
- ラボメンバーからの建設的な批判によるプロジェクトの軌道修正
- ほぼ毎週ある研究に関する個別ミーティングを通じた論理的思考回路の構築
- 多様な研究プロジェクトを見聞きする中で広範な科学領域に対する理解の提供
- 主体的に貪欲に学び続ける習慣と、それを人にシェアすることで自らのさらなる学びとする機会の提供
- 教員による補佐のもと、博士課程学生は修士の学生を、修士課程学生は学部学生を指導するという、高等教育の経験
- マイプロジェクトとして自らの興味に応じてプロジェクトを0から立ち上げる経験
- 最先端の学術論文やテクノロジーを毎週学ぶ機会
- 英語運用能力の向上
- 発表プレゼンや書類等の手直しを通じた、研究者として生き残るための「聴衆への上手な見せ方」指南
- 倍率5倍, 10倍, 20倍の競争率に勝ち採択された過去の学振DCやグラントの申請書をシェアすることで、近い将来不可欠になる採択される申請書を書く秘訣を学ぶ機会の提供
- 最初は促されつつも、いずれは自主的に全国規模のセミナー等でみなの前で発言できるだけのセンスと度胸の養成
- 2年に1本以上の頻度で筆頭著者として英語学術論文を国際誌に発表できる可能性
- 書籍、各種記事等を執筆する機会
- (研究成果に特許性がある場合は) 特許出願経験 + 特許収入
- (研究成果に社会的インパクトがある場合は) プレスリリース、記者会見経験
- 少なくとも2ヶ月に1回の清水との面談・雑談により研究以外の困っていることを自由に相談できる環境
- (希望者のみ) 週に1回昼食をともにしながらデータ科学関連の他分野の先生、学生との交流
- (希望者のみ) 年に1回以上の国内学会発表機会の提供
- (希望者のみ) 各種奨学金申請書サポート
- (希望者のみ) 本学が実施する「データサイエンス人材育成プログラム」無料受講 (本来は受講料25万円)
といったハード・ソフト両面のbenefitを提供していますし、dryに特化することも予測した薬をwet実験で検証することを目指すこともできます。
また、経済面では各種給付型奨学金の申請を支援している他、清水研独自の大学院生への経済支援制度も用意しています。さらに、企業からも清水研卒の人をほしいとうメールを多数いただいており、清水研の教育は大きな注目を集めています。
最高の教育・研究環境で、大学院生として私たちと一緒に新しい薬を作ってみませんか？